MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 plasmid pGP6

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015430	TAC	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015430	GTT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015430	CTG	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015430	TGA	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015430	CCTA	2	8	483	490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015430	TCT	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015430	GGT	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015430	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015430	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015430	GATCA	2	10	1345	1354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015430	CTC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015430	AG	3	6	1395	1400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015430	TTGT	2	8	2226	2233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015430	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015430	TAG	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015430	ATC	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015430	AT	3	6	2326	2331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015430	TA	3	6	2364	2369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015430	AT	3	6	2390	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015430	GTT	2	6	2745	2750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015430	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015430	TGA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015430	CCTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015430	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015430	GAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015430	T	6	6	3332	3337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015430	A	6	6	3414	3419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015430	ATA	2	6	3446	3451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015430	T	8	8	3453	3460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015430	ACC	2	6	3495	3500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015430	A	6	6	3503	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015430	CTC	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015430	AAG	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015430	ACC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015430	TTG	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015430	ATTAT	2	10	5783	5792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015430	T	7	7	5792	5798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015430	CT	3	6	6589	6594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015430	TGA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015430	GGCG	2	8	6745	6752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015430	TCTTT	2	10	6756	6765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015430	T	7	7	6763	6769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015430	TAC	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015430	TA	3	6	6799	6804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015430	ATT	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015430	GCC	2	6	6957	6962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015430	TCC	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015430	AGC	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015430	CTCA	2	8	7058	7065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015430	TTC	2	6	7165	7170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015430	AAG	2	6	7183	7188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015430	ATT	2	6	7493	7498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015430	TTA	2	6	7548	7553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015430	A	7	7	7591	7597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015430	G	6	6	7599	7604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015430	C	6	6	7620	7625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_015430	TA	3	6	9887	9892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015430	TCT	2	6	9917	9922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015430	CTT	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015430	AAG	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015430	AGAT	2	8	10035	10042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015430	GA	3	6	10591	10596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015430	A	6	6	10607	10612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015430	ATTCGT	2	12	10621	10632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015430	TA	3	6	10677	10682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015430	TCT	2	6	10697	10702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015430	ATCAAT	2	12	10716	10727	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015430	TAT	2	6	10795	10800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015430	CTGG	2	8	11388	11395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015430	T	6	6	11403	11408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015430	ATTACT	2	12	11409	11420	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015430	AAT	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015430	A	6	6	11481	11486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015430	CTC	2	6	11823	11828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015430	AT	3	6	11952	11957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015430	ATT	2	6	11982	11987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015430	A	6	6	12016	12021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015430	G	6	6	12047	12052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015430	TTC	2	6	12098	12103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015430	ACTT	2	8	12154	12161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015430	GCA	2	6	12237	12242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015430	GGC	2	6	12250	12255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015430	TGA	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015430	GT	3	6	12292	12297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015430	AGA	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015430	GGCA	2	8	12344	12351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015430	ATTA	2	8	12980	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015430	ATT	2	6	13025	13030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015430	TTGT	2	8	14827	14834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015430	A	7	7	14854	14860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015430	TAG	2	6	14882	14887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015430	ATC	2	6	14908	14913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015430	AT	3	6	14927	14932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015430	TA	3	6	14965	14970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015430	AT	3	6	14991	14996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015430	CTCC	2	8	15021	15028	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_015430	CTG	2	6	15094	15099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015430	GCC	2	6	15128	15133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015430	GTT	2	6	15348	15353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015430	CTG	2	6	15725	15730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015430	TGA	2	6	15743	15748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015430	CCTA	2	8	15804	15811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015430	TCT	2	6	15842	15847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015430	TATC	2	8	15887	15894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015430	ACA	2	6	15907	15912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015430	TA	3	6	15927	15932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015430	GGT	2	6	17104	17109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015430	CTT	2	6	17118	17123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015430	ATA	2	6	17130	17135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015430	TGG	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015430	G	7	7	17682	17688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015430	CGA	2	6	17705	17710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015430	G	7	7	17729	17735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015430	G	7	7	17772	17778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015430	GAG	2	6	17800	17805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015430	A	6	6	17816	17821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015430	CTT	2	6	17841	17846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015430	AGG	2	6	17911	17916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015430	G	6	6	17915	17920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015430	ACC	2	6	17924	17929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015430	CTC	2	6	17930	17935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015430	C	8	8	17935	17942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_015430	G	6	6	17945	17950	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015430	ATT	2	6	17952	17957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015430	A	10	10	18010	18019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.